A través de este documento de planificación y gestión, que cumple con ser el referente operativo para el Ordenamiento Territorial, podemos definir el uso actual y potencial del territorio según sus ventajas y limitaciones con respecto al desarrollo sostenible. 

En Cusco este proceso se inició el 2003, llegando a concluir el 2013 a nivel Meso; es decir, aplicado a espacios de nivel provincial y de cuencas. Conservación Amazónica – ACCA ha sido parte de este proceso, sobre todo brindando información sobre biodiversidad y ecosistemas de algunos ámbitos de trabajo institucional de la región cusqueña.

En Madre de Dios, durante el 2017 se culminó el proceso de ZEE a nivel macro, el cual estuvo liderado por el Gobierno Regional y fue un proceso participativo en el que Conservación Amazónica – ACCA cumplió un rol importante brindando información técnica vinculada a su trabajo institucional de la región